《立案追诉标准（二）》第六十一条之一规定：虚开刑法第二百零五条规定以外的其他发票，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
  （一）虚开发票一百份以上或者虚开金额累计在四十万元以上的；
  （二）虽未达到上述数额标准，但五年内因虚开发票行为受过行政处手二次以上，又虚开发票的；
  （三）其他情节严重的情形。
实践中，具体适用本罪案的立案追诉标准规定时，应注意以下几个问题：
  (1)关于第1项的虚开份数和虚开金额的数量标准。本项规定主要是参照《立案追诉标准（二）》第66条非法制造、出售非法制造的发票案、第68条非法出售发票案的立案追诉标准。上述条文中的“发票”指增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票以外的普通发票，立案追诉标准均为100份以上或者票面额累计在40万元以上。虚开发票罪中的“发票”也是指普通发票，立案追诉标准有必要保持一致。经征求意见，有部门提出目前百元版、千元版和万元版的发票格式不同，票面额与虚开金额不完全一致，建议将“票面额”修改为“虚开金额”，既与《刑法》保持一致，也更加准确。我们采纳了该意见。
  (2)关于第2项行为人受过2次行政处罚后又实施违法行为需要立案追诉的情形。本项规定主要考虑：一是有利于立案追诉标准与《税收征收管理法》、《发票管理办法》等行政法律法规相协调，有利于行政执法与刑事司法的衔接；二是《立案追诉标准（二）》关于行为人受过2次行政处罚后又实施违法行为需要立案追诉的情形一般表述为“虽未达到上述数额标准，但两年内因……受过行政处罚二次以上，又……的”，但《税收征收管理法》第86条规定：“违反税收法律、行政法规应当给予行政处罚的行为，在五年内未被发现的，不再给予行政处罚”。因此，这里将“两年内”调整为“五年内”，与《税收征收管理法》的规定保持一致，实际上也加大了打击力度。
 （3）关于第2项兜底条款。这是考虑到实践中虚开发票行为的情况比较复杂，很难列举全面，为了不遗漏其他情形，放纵犯罪，作了兜底性规定。实践中，如虚开发票违反所得数额较大，或者虚开发票致使国家税款损失数额较大等，应予立案追诉。

认定虚开发票最应注意的问题

（一）虚开发票罪罪与非罪的界限

行为人实施的虚开发票行为是否构成虚开发票罪，除法定的犯罪构成要件外，主要看其虚开发票的行为是否达到《立案追诉标准（二）的补充规定》第2条规定的三项标准。对于尚未达到立案追诉标准的一般虚开普通发票行为，尚不够刑事处罚的，可以根据《发票管理办法》第37条的规定，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

      （二）一罪与数罪问题

行为人虚开发票后，又利用虚开的发票实施逃税、洗钱、非法经营、贪污贿赂、侵占等违法犯罪活动，同时构成虚开发票罪和其他犯罪的，二行为之间存在手段与目的的牵连关系，应当按照牵连犯的处理原则，从一重罪处断。